Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms