Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp2P29594 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms