Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrbP28704 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrbP28704 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrbP28704 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms