Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LoxP28301 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LoxP28301 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LoxP28301 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LoxP28301 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LoxP28301 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LoxP28301 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LoxP28301 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LoxP28301 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LoxP28301 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LoxP28301 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LoxP28301 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LoxP28301 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LoxP28301 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
LoxP28301 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LoxP28301 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LoxP28301 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LoxP28301 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LoxP28301 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LoxP28301 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms