Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms