Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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