Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZfaP23607 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms