Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms