Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18530 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18530 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18530 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18530 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18530 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18530 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18530 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18530 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18530 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18530 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18530 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18530 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18530 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18530 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18530 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18530 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18530 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18530 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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