Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApcsP12246 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ApcsP12246 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApcsP12246 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms