Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms