Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms