Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms