Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms