Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JtbO88824 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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JtbO88824 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JtbO88824 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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JtbO88824 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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JtbO88824 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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JtbO88824 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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JtbO88824 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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JtbO88824 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
JtbO88824 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JtbO88824 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JtbO88824 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JtbO88824 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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JtbO88824 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JtbO88824 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JtbO88824 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JtbO88824 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JtbO88824 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JtbO88824 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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JtbO88824 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JtbO88824 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JtbO88824 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
JtbO88824 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JtbO88824 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JtbO88824 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
JtbO88824 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JtbO88824 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JtbO88824 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JtbO88824 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms