Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms