Protein–RNA interactions for Protein: O70172

Pip4k2a, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2aO70172 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4k2aO70172 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4k2aO70172 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms