Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad51dO55230 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms