Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms