Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms