Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms