Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DffaO54786 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DffaO54786 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DffaO54786 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DffaO54786 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DffaO54786 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DffaO54786 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DffaO54786 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DffaO54786 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DffaO54786 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DffaO54786 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DffaO54786 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DffaO54786 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DffaO54786 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DffaO54786 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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