Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ3O43525 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ3O43525 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms