Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXO3O43524 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms