Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FxnO35943 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FxnO35943 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FxnO35943 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FxnO35943 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms