Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms