Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms