Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms