Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm5849J3QPE5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm5849J3QPE5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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