Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c3J3QJW5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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