Protein–RNA interactions for Protein: G3X996

Zfp846, RIKEN cDNA 2210010B09, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp846G3X996 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Zfp846G3X996 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp846G3X996 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms