Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Igkv1-99F6XWB2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms