Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN3

Gm1979, Predicted gene 1979, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1979E9QAN3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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Gm1979E9QAN3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Gm1979E9QAN3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Gm1979E9QAN3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Gm1979E9QAN3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Gm1979E9QAN3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Gm1979E9QAN3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Gm1979E9QAN3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Gm1979E9QAN3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Gm1979E9QAN3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Gm1979E9QAN3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm1979E9QAN3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm1979E9QAN3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm1979E9QAN3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm1979E9QAN3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm1979E9QAN3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm1979E9QAN3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm1979E9QAN3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm1979E9QAN3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm1979E9QAN3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm1979E9QAN3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm1979E9QAN3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm1979E9QAN3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm1979E9QAN3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms