Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms