Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap46E9Q2C0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap46E9Q2C0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap46E9Q2C0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap46E9Q2C0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap46E9Q2C0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap46E9Q2C0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap46E9Q2C0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms