Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms