Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms