Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms