Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms