Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms