Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms