Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Siah3B2RWG3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms