Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb8B1AY40 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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