Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AgrnA2ASQ1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms