Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms