Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf2A2A5Z6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf2A2A5Z6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms