Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms