Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SDK2-201ENST00000392650 10723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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