Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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