Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
NEUROD1Q13562 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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